Атлантис е спасен в последния момент от Дедал, който успява да унищожи останалите два корабa кошери. Въпреки това, още 12 са на път и те бързо се адаптират към мерките на Таури. МакКей и екипа му трябва да инсталират новият МНТ и да повишат щитовете на града, за да защитят Атлантис, преди останалата част от Призрачният флот да пристигне и да превземе града. Междувременно, екипът намира и лейтенант Ейдън Форд, който е получил предозиране от ензима на един рейфовете.
