Děj se odehrává pouze týden po událostech z finále minulé sezóny, kde Peter zachránil oba vesmíry, což mělo za následek jeho vymazání z existence. Příměří mezi oběma vesmíry přetrvává a obě strany jsou nuceny spolupracovat v zájmu řešení toho, co před nimi stojí. Lincoln Lee se připojuje k týmu Fringe divize při řešení případu, který je pro něj velmi osobní...
