V hloubce 500 stop pod hladinou oceánu právě ponorka USS Colorado obdržela rozkazy. Ty však přišly přes kanál, který je vyhrazen pouze pro případy, kdy by došlo ke zničení USA, a jejich obsahem je navíc rozkaz k útoku jadernými zbraněmi na spřátelený Pákistán. Kapitán Marcus Chaplin požádá o potvrzení rozkazu, obratem je však zdánlivě bezdůvodně zbaven velení. Jeho zástupce, XO Sam Kendal, se znenadání ocitá v situaci, kdy musí učinit stejně složité rozhodnutí, jako jeho kolega. Když odmítne střely odpálit, aniž by dostal oficiální potvrzení rozkazu, stává se USS Colorado cílem nečekaného torpédového útoku a je zasažena. Posádka ponorky je tak uvězněna na dně oceánu a navíc jsou nyní považováni za nepřátele vlastní země a veřejně označeni za zrádce. Protože se nemají na koho obrátit, Chaplin a Kendal se rozhodnou s ponorkou utéct a brzy se objevují u pobřeží exotického ostrova Santa Marina. Aby zabránili jakémukoliv útoku na svou posádku, kapitán Chaplin oficiálně vyhlásí ostrov jako jejich novou základu a pokud někdo pronikne do jeho blízkosti, z ponorky budou odpáleny jaderné střely. Členové posádky a jejich přátelé v USA tak nyní musí udělat vše pro to, aby své milované dostali v pořádku domů a rozpletli jedno z největších spiknutí v americké historii...
