Arthur Brown, le Maître des Indices, s'échappe du pénitencier de Blackgate, cinq ans après que Sophie l'y a envoyé. Afin de se venger, il organise une nouvelle énigme qu'elle doit résoudre avec l'aide de Mary et Ryan dans le but de sauver une personne qu'il a empoisonnée : Stephanie Brown, sa propre fille.
