L'Intelligence si unisce all'FBI dopo che una bomba esplode durante un festival di strada annuale a Chicago. Il caso diventa personale per Burgess quando il suo ex partner Frank Toma che l'ha aiutata ad addestrare scompare dopo l'esplosione e le prove che collegano alla bomba che monta un gruppo terroristico, però Toma si uccide davanti agli occhi di Burgess. Nel disperato tentativo di provare l'innocenza di Toma, Burgess si oppone a Voight per indagare più a fondo con l'aiuto di Dawson, e i due scoprono che Toma stava lavorando sotto copertura per sgominare un gruppo terroristico.
