Во вступлении, которое показывает события 52 серии, показано разрушенное убежище Оротимару, в котором нахоядтся Саскэ и Команда Какаси: Наруто, Сакура и её новый член — Сай. Наруто говорит с Саскэ о прошлом, о Долине Завершения, и понимает, что лучший друг уже не тот. Более того, Саскэ демонстрирует Удзумаки свои способности, заглянув во внутренний мир Наруто и увидев там Девятихвостого Лиса. Реальная же история сериала начинается с возвращения Наруто и Дзирайи в Коноху. Зрителям вновь представляют некоторых персонажей аниме, таких как Сакура, Конохамару, Сикамару, Тэмари и Какаси.
