Alevilerin toplumun diğer fertlerinden kaçarak, saklanarak yaşamak zorunda bırakıldıkları hayatlarını beyazperdeye taşıma gayretinde olan "Saklı Hayatlar", Alevilerin maruz kaldığı ötekileştirilmeyi, ayrımcılığı konu ediniyor. Gerçek olaylardan esinlenerek çekilen film, sıradan insanların yaşadığı kimlik çatışmalarının yol açtığı gerçek bir trajediyi perdeye taşıyor. Film, Sünni kimliğine bürünen Alevi bir ailenin, Sünni üst komşularıyla kesişen hayatlarını anlatıyor. Bu saklanan hayatlar arasında yeşeren bir aşk öyküsü, gizlenmek zorunda bırakılan kimlikleri ortaya çıkaracaktır.
