Kindaichi wird von seinem Kindheitsfreund Kentarou Izawa, welcher als Programmierer arbeitet, gebeten, bei der Aufklärung eines Todesfalls zu helfen. Izawas Auftraggeber Seiryuu Himatsuri wurde von einem Zug überfahren und regelrecht in zwei Hälften geteilt. Was zunächst nach einem Unfall aussah, gewinnt an Brisanz, als sich im Anwesen Himatsuris eine Voodoo-Puppe findet, welche ebenfalls zweigeteilt wurde. Kindaichi und Miyuki begeben sich daraufhin mit Izawa zum Himatsuri-Anwesen, wo sie die drei Kinder des Verstorbenen antreffen. Diese scheinen stark abergläubisch zu sein und praktizieren unter der Anleitung eines mysteriösen Lehrmeisters schwarzmagische Rituale. Kurz nach ihrer Ankunft kündigen sich mit dem Fund einer weiteren Voodoo-Puppe weitere tragische Ereignisse an, die Kindaichis Fähigkeiten ein weiteres Mal auf die Probe stellen sollen.
