Сплинтер сажает черепашек под домашний арест из-за того, что Майки катался на скейтборде в логове. Когда черепашки скрытно от Сплинтера сбегают из логова, несмотря на его указания, они теряют Ч-Под (который содержит в себе важный чип) и теперь должны победить Бакстера Стокмана, работника ИТКИ, который использует чип, чтобы модернизировать его броню и отомстить компании ИТКИ за его увольнение.
