Много лет назад Хамато Йоси начал новую жизнь в США, покинув Японию. Но однажды по дороге домой из зоомагазина он подвергся нападению странного человека со светящейся жидкостью в колбе. В результате потасовки колба разбилась, и в результате воздействия ядовитого вещества Хамато превратился в крысу, а четыре его питомца из зоомагазина — в огромных черепашек. Последующие годы черепашки-мутанты под руководством мудрого и умелого сенсея жили в изоляции от мира, практиковались в единоборствах и учились терпению. Теперь они готовы выйти на поверхность, чтобы вступить в схватку со злом.
