人类补完委员会召开了特别召集会议，对 NERV 的成绩作总结。对于使徒侵入一事，碇源度予以否认。与此同时，机体互换实验正在进行中。丽可顺利乘坐初号机，但真嗣却受到了来自零号机的精神污染。又一次陷入暴走状态的零号机，拼命地攻击观察室的窗户。这样的情形，在美里的心里引起了不少的疑问，但律子却对于暴走的原因予以保留。 （上半集的片子，可以说是 EVA 全剧上半部分的总集篇，但也加入了不少新的情报。下半集中有不少发人深思的台词，近结尾时，零号机持着隆基努斯之枪走向莉莉斯，不少新的谜团又被引发出来。黑底白字的解说字幕，在系列中出现最多，分镜头也一样，可以说这一话的构成与编辑都做得十分辛苦。）
