A történet a Bosszúállók című mozifilm utáni időben indul, amikor Phil Coulson (aki túlélte a látszólagos halált) egy kis csapatnyi ügynök élén próbálja kideríteni, hogy mi okozhatja Mike Peterson (J. Richards) emberfeletti képességeit, aki képes túlélni egy épület felrobbanását. Eközben egy "hacktivista" csoport, az úgynevezett "Rising Tide" is képbe kerül, kiknek eltökélt céljuk, hogy kiderítik és nyilvánosságra hoznak minden titkot, amit a kormányok, ügynökségek meg akarnak tartani maguknak. Skye - a Rising Tide tagja - találkozik Peterson-al, hogy figyelmeztesse, hogy a S.H.I.E.L.D a nyomában van....
